本校創設於民國25年，原為臺灣總督府立水產講習所，民32年改 為台北州立基隆水產學校，民國34年臺灣光復後正名為臺灣省立基隆水產學校，民國42年改為省立基隆高級水產職業學校，民國59年改名為省立基隆高級海事職業學校，民國89年2月改為國立基隆高級海事職業學校，民國109年8月改隸為「國立臺灣海洋大學附屬基隆海事高級中等學校」。